Povolení výjimky ze zákazů ve zvláště chráněném území
Povolování výjimky ze zákazů definovaných v zákoně o ochraně přírody a krajiny na území národního parku, chráněné krajinné oblasti, národní přírodní rezervace, přírodní rezervace, národní přírodní památky a přírodní památky
Zrušení certifikátu k regulovaným látkám nebo fluorovaným skleníkovým plynům
Ministerstvo může zrušit certifikát při závažném porušení podmínek uvedených v certifikátu nebo povinností stanovených zákonem 73/2012 Sb. anebo povinností stanovených přímo použitelnými předpisy Evropské unie (nařízení 1005/2009 a 517/2014).