Pokud podle čl. 17 nařízení Evropského parlamentu a Rady (ES) č. 1013/2006 není podáváno nové oznámení, ministerstvo může na základě oznámení změny v přeshraniční přepravě rozhodnout o změně vydaného rozhodnutí.
Změny v havarijním plánu pro nakládání s geneticky modifikovanými organismy ve 3. nebo 4. kategorii rizika na Ministerstvo životního prostředí
Osoba oprávněná k uzavřenému nakládání 3. a 4. kategorie rizika je povinna zaslat Ministerstvu životního prostředí havarijní plán při změně skutečností, které by mohly mít vliv na opatření stanovená pro případ havárie, a to do 30 dnů.