Povolení výjimky ze zákazů ve zvláště chráněném území
Povolování výjimky ze zákazů definovaných v zákoně o ochraně přírody a krajiny na území národního parku, chráněné krajinné oblasti, národní přírodní rezervace, přírodní rezervace, národní přírodní památky a přírodní památky
Uložení plnění povinností osobám, které se zúčastnili nedovolené přeshraniční přepravy odpadů
V případě přeshraniční přepravy, kterou nelze dokončit, nebo nedovolené přeshraniční přepravy může ministerstvo uložit splnění povinností podle čl. 22 až 25 nařízení Evropského parlamentu a Rady (ES) č. 1013/2006.