Cílem projektů, zaměřených na ochranu zvláště chráněných druhů, které MŽP připravuje nebo se v nich zapojuje v roli partnera, je často podpora populací ohrožených druhů, zajištění vhodné péče o biotopy druhů, zajištění spolupráce a dobré komunikace všech zainteresovaných subjektů na národní i evropské úrovni. Finanční prostředky čerpáme zejména z programů LIFE nebo Interreg.
V současné době probíhají 3 mezinárodní projekty na podporu ochrany zvláště chráněných druhů.
Cílem projektu je rozvoj aktivních nástrojů druhové ochrany a komplexní realizace schválené Koncepce aktivních nástrojů druhové ochrany v České republice 2023–2032, ale také příprava a koordinace Strategie ochrany biologické rozmanitosti 2025–2050 nebo Strategie ochrany opylovačů v ČR. Součástí je systematická a cílená osvěta aktivní druhové ochrany směrem k veřejnosti a stakeholderům a odborná a metodická podpora orgánů ochrany přírody pro efektivnější druhovou ochranu.
Trvání: 2025–2028 Program: INTERREG Rakousko – Česko MŽP: vedoucí partner Hlavním cílem je vytvořit alianci Rakouska a Česka pro společné přírodní dědictví Horní Malše. Umožní vytvoření dlouhodobé platformy MalšeDialog pro výměnu informací, deklarování společných cílů v území, koordinaci managementu, řešení konfliktů v ochraně přírody a realizaci opatření pro stanoviště a druhy. Pro zachování unikátního ekosystému je nezbytné zapojení 9 klíčových zainteresovaných stran, zejména správců různých fenoménů v území.