Druhová ochrana je součástí zásadních národních strategických dokumentů a politik na ochranu přírody a krajiny. Jedná se zejména o:
Zajišťování efektivní ochrany druhů je úzce závislé na dostupností kvalitních dat k biologii, ekologii a také výskytu druhů. Digitalizované Červené seznamy ohrožených druhů ČR jsou dostupné na portálu Informačního systému ochrany přírody (ISOP) AOPK ČR. Data o výskytu druhů jsou shromažďována v Nálezové databázi ochrany přírody (NDOP) AOPK ČR. Pro sběr dat o výskytu druhů v ČR je specialisty i odbornou veřejností využívána Aplikace BioLog nebo Aplikace iNaturalist. Jednotlivé druhy, jejich rozšíření a stav v ČR představují karty druhů.
Schválené metodiky MŽP a další relevantní materiály k druhové ochraně jsou k dispozici ke stažení dle jednotlivých tematických skupin. Metodické materiály v oblasti ochrany druhů doplňují metodiky k invazním nepůvodním druhům.
Organismy v krajině
Savci
Ptáci
Obojživelníci a plazi
Ryby a mihule
Bezobratlí živočichové
Rostliny, houby a lišejníky
Zdroj dat: AOPK ČR, online dostupné na stránkách CENIA.